В позднем эоцене, на уровне 42±9 млн лет назад, происходит резкое похолодание климата, которое связывают с появлением циркумантарктического теченияГоризонтальное перемещение воды в море.Течения несут воду с определеннойтемпературойи соленостью. Они также переносят с собойи морские организмы.Наиболее известныетечения —Гольфстрим,течение Гумбольдтаи Куросио. Западных Ветров в связи с углублением дна Тасманова пролива и возникновением пролива Дрейка, пока еще мелководного. Течение Западных Ветров изолировало Южный океан от Мирового, что привело к началу оледенения Антарктиды. С этого времени начинается кайнозойский ледниковый режим, и океаническая циркуляция приобретает все основные черты, свойственные современному океану. Усиливающееся похолодание увеличивает флоро-фаунистические различия между отдельными частями Тетиса, а тектонические события конца раннего миоцена, около 18 млн лет назад, приведшие к соединению Евразии с Африкой, прервали существование Тетиса как единого морского бассейна. Со среднего миоцена происходит формирование центральноамериканского перешейка. Таким образом, становление современных разорванных тропических фаун нужно относить к миоцену.

Пределы распространения неогеновых тропических областей были много больше современных. На северных и южных перифериях этих областей под влиянием продолжавшегося похолодания происходило, начиная с миоцена, формирование бореальных Североатлантической и Северотихоокеанской областей, а также потальных областей (их число, границы и даже наименования очень по-разному понимаются разными исследователями и здесь не обсуждаются). Таким образом, Североатлантическая область есть производное Западноатлантической и Западноафриканской областей, а Северотихоокеанская — Индо-Вестпацифической и Восточиотихоокеанской областей. Северотихоокеанская область, особенно ее северо-западная часть, унаследовав исключительно высокое видовое богатство Индо-Полинезийской провинции Индо-Вестпацифической области, оказала решающее значение для формирования биоты умеренных и холодных вод всего Северного полушария.

Биота Северного Ледовитого океана (Полярного бассейна) в раннем палеогене развивалась под значительным влиянием тетисной биоты, представители которой мигрировали в высокие широты Северного полушария через Тургайский проливпролив — относительно узкое водное пространство, разделяющее какие-либо участки суши и соединяющее водные бассейны или их части. Обычно по гидрологическому режиму проливы несколько отличаются от смежных водоёмов, что объясняется особенностями последних, а также длиной, шириной и глубиной самих проливов. Типичны течения, часто различающиеся по направлению в поверхностных и придонных слоях; наблюдаются приливы, отливы и сгонно-нагонные явления значительно большей амплитуды, чем в открытом море. По длине лидирует Мозамбикский пролив (1760 км), шир. и глуб. максимальны у Дрейка пролива (соответственно до 1120 км и 5249 м). (см. рис. 86). Реликты этой специфической палеогеновой биоты могут быть обнаружены среди представителей современной глубоководной фауны Полярного бассейна. После закрытия Тургай-ского пролива и разрушения Берингийского моста суши, а также моста суши (так называемого моста Туле), соединявшего Европу с Северной Америкой (см. раздел 5.1) фауна и флора Северного Ледовитого океана формировались под непосредственным влиянием североатлантической биоты.